USB P.Drive ¿como saber si esta infectado?

Tengo un P.drive el cual utilizo para llevar documentos y archivos de importancia a la universidad, los computadores usados por la misma utilizan todos Ubuntu 13.04/12.04 todo bien hasta allí.Pero hace unos días he tenido que prestar el mismo a un compañero y luego a un profesor con sus respectivos computadores Windows y he notado algo diferente que ya no puedo renombrar archivos (carpedas,pdfs,img) no reconoce algunas veces mayúsculas ni guiones. Es esto por lo tanto síntomas de algún "gusanillo" oculto? ¿que medidas puedo tomar desde GNU/LINUX? ¿algún escáner o antivirus para analizar el dispositivo?